Francisco tuvo una relación muy afectuosa con las instituciones y los atletas argentinos que lo visitaron. A través de redes sociales, la AFA, el Comité Olímpico Argentinos y los diferentes clubes despidieron al Sumo Pontífico. 

"Profundo dolor. La AFA, en nombre del presidente Claudio Tapia y del Comité Ejecutivo expresa su más sentido dolor por el fallecimiento del Papa Francisco, Jorge Mario Bergoglio, quien en 2013 se convirtió en el primer argentino en liderar la Iglesia Católica", publicó la casa madre del fútbol argentino.

#ProfundoDolor La @afa, en nombre del Presidente Claudio Tapia y del Comité Ejecutivo, expresa su más sentido dolor por el fallecimiento del Papa Francisco, Jorge Mario Bergoglio, quien en 2013 se convirtió en el primer argentino en liderar la Iglesia Católica. pic.twitter.com/8iAOn53TnK

— AFA (@afa) April 21, 2025

San Lorenzo, club del que Francisco era hincha reconocido, publicó un emotivo mensaje, en el que recordó el amor por la institución, que trascendió todas las etapas de su vida. "Nunca fue uno más y siempre fue uno de los nuestros. Cuervo de niño y de hombre... Cuervo como sacerdote y Cardenal... Cuervo también como Papa...", arranca la publicación de San Lorenzo, con un video en el que se muestra su carnet de socio y cuando confirmó a Ángel Correa en la concentración del estadio en el Bajo Flores. 

Nunca fue uno más y siempre fue uno de los nuestros. Cuervo de niño y de hombre... Cuervo como sacerdote y Cardenal... Cuervo también como Papa...

Siempre transmitió su pasión por el Ciclón: cuando iba al Viejo Gasómetro para ver al equipo del 46, cuando confirmaba a Angelito… pic.twitter.com/nVc8fWC9wi

— San Lorenzo (@SanLorenzo) April 21, 2025

"Siempre transmitió su pasión por el Ciclón: cuando iba al Viejo Gasómetro para ver al equipo del 46, cuando confirmaba a Angelito Correa en la capilla de Ciudad Deportiva, cuando recibía las visitas azulgranas en el Vaticano siempre con felicidad total... Socio N°88235. De Jorge Mario Bergoglio a Francisco, hubo algo que jamás cambió: su amor por el Ciclón", completó el club.

Con inmensa tristeza despedimos al Papa Francisco, orgullo de los argentinos y guía espiritual de millones en todo el mundo gracias a su humildad, su fe y su compromiso con los más necesitados. Acompañamos a toda la comunidad en este momento de profundo dolor. pic.twitter.com/Ad6i9cklTw

— River Plate (@RiverPlate) April 21, 2025

Luego fue el turno de River, que también publicó una dedicatoria especial hacia el Papa argentino. "Con inmensa tristeza despedimos al Papa Francisco, orgullo de millones en todo el mundo gracias a su humildad, su fe y su compromiso con los más necesitados. Acompañamos a toda la comunidad en este momento de profundo dolor".

También Boca, Racing, Independiente y otras instituciones del futbol expresaon sus codolencias ante la desparición física del Papa argentino.